Przypuszcza się, że cykl ksantofilowy funkcjonuje w tylakoidach chloroplastów w celu zachowania równowagi między produkowanym ATP i NADPH poprzez utlenianie tego drugiego. Nadmiar NADPH jest również potrzebny poza tylakoidami do zahamowania niecyklicznego transportu elektronów i produkcji tlenu.
Cykl ten opiera się na kilku, może kilkunastu ksantofilach, funkcje innych związków z tej grupy, jest ich ponad 600, nie zostały wyjaśnione.
Dotychczas ustalono, że na przebieg tego cyklu wpływ wywierają: światło, zawartość azotu i fosforu. Jeśli do roli tych związków należy współdziałanie w procesie fotosyntezy, rola ochronna przed oksydacją poprzez wychwytywanie wolnych rodników, to szereg innych czynników powinno mieć również wpływ na przebieg tego cyklu, jak np.: deficyt innych miko- i makroelementów, oddziaływanie metali ciężkich, związków chemicznych uznawanych powszechnie za toksyczne w odniesieniu do roślin.